Регулярность приема лекарств при хронической почечной недостаточности и лежащий в ее основе механизм на основе интеллектуального анализа данных, сетевой фармакологии и молекулярной стыковки Ⅱ

Jan 04, 2023

2.6 Скрининг мишеней CRF Путем поиска в базах данных GeneCards и OMIM для получения терапевтических мишеней CRF, установки Relevancescore больше или равной 5 и удаления повторяющихся мишеней было получено в общей сложности 795 мишеней.

Cistance Chronic Renal Failure

 
Спросите больше:
wallence.suen@wecistanche.com 0015292862950

Cistance Chronic Renal Failure

Рис. 1 Сеть ассоциаций лекарств при условии поддержки 60 и достоверности 0,85
2.7 Скрининг общих целей и построение сети взаимодействия 795 целей CRF и 80 целей действия активного ингредиента лекарственного средства были отобраны с помощью программного обеспечения на языке R и программы на языке Perl для выявления общих целей, всего 37 были введены в программное обеспечение Venny 2.1, и полученный Wei ENTU См. Дополнение к расширенной публикации

Cistance Chronic Renal Failure


Строка STRING использовалась для ввода 37 общих целей, а белок-белковые взаимодействия (PPI) были построены в режиме «высокой достоверности: 0.4», см. Дополнительный материал к расширенной публикации. Примените плагин count.R для подсчета топ-30 белков-мишеней по частоте встречаемости, среди которых значатся IL-6, VEGFA, Caspase-3, NOS3, HIF-1 и т.д. часто.

Cistance Chronic Renal Failure

2.8 Построение биомолекулярной сети Использование Cytoscape 3.7.1 в сетевой диаграмме активный ингредиент-CRF-мишень PPI. Среди них красный представляет заболевание, фиолетовый представляет собой Xinfang 1, синий представляет собой активный ингредиент, а зеленый представляет собой общую мишень для активного ингредиента Xinfang 1 и CRF. См. дополнительные материалы расширенной публикации.

Таблица 4 Корреляционный анализ между препаратами на основе метода улучшенной взаимной информации

Cistance Chronic Renal Failure

2.9 Анализ ГО и скрининг основных путей Гистограммы и пузырьковые диаграммы, полученные в результате функционального анализа ГО вышеуказанных общих целей с использованием программного обеспечения на языке R, показаны в дополнительных материалах Расширенной публикации. Биологические процессы в основном включают связывание стероидов, активность рецепторов стероидных гормонов, активность ядерных рецепторов, активность фактора транскрипции и т. д. Предполагается, что новая формула 1 может лечить ХПН, регулируя множество сложных биологических процессов. Анализ обогащения KEGG Pathway целей Xinfang 1, основное распределение 33 общих целей
При липидном и атеросклерозе, ядерном факторе транскрипции-κB (NF-κB), Toll-подобном рецепторе (TLR), HIF-1 и других путях это показывает, что Xinfang 1 синергически лечит CRF, действуя на несколько путей.

Таблица 5 Новые рецепты лечения ХПН на основе энтропийной иерархической кластеризации

Cistance Chronic Renal Failure

2.10 Молекулярный докинг Если энергия связи меньше или равна -4 кДж·моль-1, это означает, что молекула обладает хорошей способностью связывания с мишенью. Пять основных компонентов хорошо сочетаются с целевым белком. Среди них стигмастерол имеет лучшую комбинацию с NOS3. Результаты показали, что эти 5 основных компонентов взаимодействовали с белком-мишенью и оставались стабильными после связывания. См. Таблицу 7.

Cistance Chronic Renal Failure

2.10 Молекулярный докинг Если энергия связи меньше или равна -4 кДж·моль-1, это означает, что молекула обладает хорошей способностью связывания с мишенью. Пять основных компонентов хорошо сочетаются с целевым белком. Среди них стигмастерол имеет лучшую комбинацию с NOS3. Результаты показали, что эти 5 основных компонентов взаимодействовали с белком-мишенью и оставались стабильными после связывания. См. Таблицу 7.

Таблица 7 Стыковка основных компонентов с соответствующими ключевыми молекулами-мишенями нового рецепта 1

Cistance Chronic Renal Failure

2.11 Влияние новой формулы 1 на экспрессию NOS3 у крыс CRF
2.11.1 Влияние на креатинин сыворотки и азот мочевины Креатинин сыворотки и азот мочевины (автоматический биохимический анализатор Hitachi H7600, набор для анализа креатинина и мочевины) в экспериментальной группе были значительно повышены по сравнению с контрольной группой (P<0.05), and the new formula 1 was given for treatment After treatment, serum creatinine and blood urea nitrogen were significantly lower than those in the model group (P<0.05). The results are shown in Table 8.
Таблица 8 Влияние сывороточного креатинина и азота мочевины нового рецепта 1(xˉ±s,n=10)

Cistance Chronic Renal Failure

Таблица 8 Влияние сывороточного креатинина и азота мочевины нового рецепта 1(xˉ±s,n=10)

Cistance Chronic Renal Failure

2.11 Влияние новой формулы 1 на экспрессию NOS3 у крыс CRF
2.11.1 Влияние на креатинин сыворотки и азот мочевины Креатинин сыворотки и азот мочевины (автоматический биохимический анализатор Hitachi H7600, набор для анализа креатинина и мочевины) в экспериментальной группе были значительно повышены по сравнению с контрольной группой (P<0.05), and the new formula 1 was given for treatment After treatment, serum creatinine and blood urea nitrogen were significantly lower than those in the model group (P<0.05). The results are shown in Table 8.
 

2.11.2 Влияние на содержание NO и NOS3 впочечная тканьСодержание NO и NOS3 в модельной группе было значительно ниже, чем в нормальной группе (P<0.05). After treatment with the new recipe 1, the NO and NOS3 contents were significantly higher than those in the model group (P<0.05) . The results are shown in Table 9.

3 Обсуждение
3.1 Анализ интеллектуального анализа данных В этом исследовании вспомогательная система наследования традиционной китайской медицины использовалась для анализа правил приема лекарств директором Ву Чжаодун при лечении ХПН. Путем анализа корреляционного алгоритма было установлено, что препараты директора Ву Чжаодуна, которые обычно используются при лечении ХПН, включают астрагал, лююэсюэ, смилакс смилакс, жареный атрактилодес макроцефала, пиявку, шивэй, дягиль, эвпаториум, ахирантес двузубый и алисму. На основе анализа правил рецептурных лекарств, основанных на ассоциативных правилах, установлено, что наиболее часто используемыми комбинациями препаратов являются: ① Смилакс,Цистанхеи Джунсю; ② Астрагал,Цистанхеи Джунсю; ③ Смилакс,Астрагал; Снег; ⑤ Астрагал, жареный Atractylodes macrocephala; ⑥ Жареный Atractylodes macrocephala, Liuyuexue; Новые рецепты лечения ХПН, основанные на энтропийной иерархической кластеризации, включают: ① горький миндаль-астрагал-колокольчик-дангги-смилакс-жареный Atractylodes macrocephala; Эфедра жженая из листьев мушмулы; ④Су стебель-кодонопсис-коптидис-гетерофилла гетерофилла; диарея; ⑦Scutellaria baicalensis-пиявка-красный корень пиона-листья мушмулы-Adenophora;
Директор У Чжаодун считает, что CRF в основномвовлекает селезенку и почки, а по патогенезу делят на дефицит и избыток. ДеСиндром дефицита в основном вызван недостаточностью селезенки и почек., а лечение заключается в том, чтобы оживитьселезенка и почки. Повышение влажности, гармонизация сети и выделение мути и т. Д. Астрагал, дягиль и жареные корневища атрактилодеса ​​в основном используются для пополнения ци и крови; пиявка, эвпаториум и двузубый ахирантес в основном используются в качестве лекарств для улучшения кровообращения и устранения застоя крови; .

 

3.2 Потенциальный механизм действия New Prescription 1 New Prescription 1 состоит из астрагала, дягиля, жареного Atractylodes macrocephala, кокоса Smilax, горького миндаля и колокольчика. В рецепте Astragalus membranaceus сладкий на вкус и слегка теплый по своей природе, и он относится к меридиану селезенки и легких.

 

Cistanche can treat chronic kidney disease

 

 

Сырость и другие эффекты, он может вылечить CRF Sanjiao Shishi [10], это препарат монарха; Анжелика сладкая и острая, теплая по своей природе, возвращается к сердцу, печени и меридиану селезенки, имеет функцию улучшения кровообращения и является лекарством-служителем.

Совместимость астрагала, дягиля, монарха и министра, питающая ци и кровь, может значительно снизить белок в моче, ингибировать почечный фиброз и увеличить содержание эритропоэтина [11]. Жареные Atractylodes macrocephala сладкие на вкус, горькие по своей природе и теплые по своей природе. Он относится к меридиану селезенки и меридиану желудка. Регулируют микроэкологию кишечника, ингибируют эндотоксины,
Воспроизведение иммуномодулирующего действия [13], а также в качестве адъювантного препарата. Астрагал, дягиль, цистанхе и атрактилодесmacrocephala являются основными комбинациямидля питания селезенки, почек и крови[14. Smilax tuckahoe сладкий и легкий на вкус, плоский по своей природе и относится к меридиану печени и желудка. Всего адъювантной медицины. Горький миндаль и Platycodon grandiflorum являются лекарственными парами. Горький миндаль подавляет и опускается, Platycodon grandiflorum восходит и восходит. Один поднимается, а другой опускается, выравнивая движение ци, регулируя водные каналы, диурез и уменьшая отек, очищая мутность мокроты [16]. Директор Ву Чжаодун считает, что у пациентов с ХПН мутность и яд не уменьшаются, а восходящее и нисходящее движение висцеральной ци блокируется. Метод «поднятия горшка и раскрытия» часто используется для восстановления движения ци, что способствует выведению злых мути, застоев и токсинов.
Для изучения потенциального механизма нового рецепта 1 в лечении ХПН были дополнительно проведены прогнозирование сетевой фармакологии, молекулярный докинг и экспериментальная проверка. Результаты показали, что 28 биоактивных компонентов Новой Формулы 1 были отсеяны, а ключевыми активными компонентами были -ситостерол, стигмастерол, кверцетин, изорамна Су, кемпферол. На основе сети взаимодействия активный ингредиент-CRF-мишень были обнаружены ключевые мишени, такие как IL-6, VEGFA, Caspase-3, NOS3 и HIF-1. -ситостерол может снижать уровень общего холестерина в сыворотке, тем самым подавляя повреждение почек [17]. -ситостерол может ингибировать М1-поляризацию макрофагов, усиливать М2-поляризацию, снижать уровни TNF- и IL-6 и ингибировать TLR для регуляции иммунитета [18]. Стигмастерол — природный стероид, который ингибирует путь LPS/TLR для улучшения системного воспалительного ответа [19], регулирует ось TNF-/VEGFR и ингибирует ангиогенез [20]. Изорхамнетин ингибирует фиброз, ингибируя образование внеклеточного матрикса, действуя на пути TGF- 1/Smad3 и TGF- 1/p38 MAPK [21]. Кемпферол может значительно уменьшить окислительный стресс и перекисное окисление липидов путем ингибирования пути ASK1/MAPK [22]; ингибируют высвобождение воспалительных факторов через сигнальный путь NF-κB [23].

IL-6 участвует в процессах иммунного воспаления и почечного фиброза путем активации JAK/STAT, Ras-Raf MAP и других путей в условиях высокого уровня глюкозы [24]. VEGFA является подтипом VEGF, и комбинация VEGFA и VEGFR2 может усугубить почечный интерстициальный фиброз [25]. Каспаза -3 опосредует экспрессию GSDME в клетках почечных канальцев CRF, вызывая вторичный некроз и фиброз [26]. Рецептор почечного эпидермального фактора роста может опосредовать аутофагию подоцитов и воспалительную инфильтрацию[27]
. NOS3 может снижать уровень СОД, оказывать антиоксидантное и противовоспалительное действие [25]. Эксперименты на животных также показали, что после лечения Новой Формулой 1 уровни NO и NOS3 были значительно выше, чем в экспериментальной группе, что позволяет предположить, что Новая Формула 1 может оказывать антиоксидантное и противовоспалительное действие, воздействуя на NOS3.

 

В сочетании с базой данных KEGG для анализа аннотаций путей было обнаружено, что активные ингредиенты Xinfang 1 могут воздействовать на липиды и атеросклероз, NF-κB, TLR, HIF-1 и другие пути. Липид и атеросклероз являются основными факторами ХПН в сочетании с сердечно-сосудистым риском[28]; Путь NF-κB активирует воспалительную реакцию и участвует в прогрессировании ХПН[29]; TLRопосредует врожденный иммунный ответ, опосредует воспаление и повреждение почекипочечный фиброз[30]; HIF-1 регулирует чувствительность почек к кислороду, что приводит к почечной гипоксии и интерстициальному фиброзу, что является ключом к лечению ХПН [31].

effect of cistanche improve kidney function (2)

Таким образом, новая формула 1 может воздействовать на IL-6, VEGFA, каспазу-3, NOS3, HIF-1 и другие мишени через -ситостерол, стигмастерол, кверцетин, изорамнетин, кемпферол и другие компоненты. . Регулируют липидный и атеросклероз, NF-κB, TTLR, HIF-1 и другие пути, играют несколько ролей
CRF можно лечить путем интеграции регуляторных эффектов в нескольких точках, нескольких мишенях, нескольких путях и нескольких связях. Молекулярный докинг также подтвердил наличие сильной связывающей активности между вышеуказанными компонентами и мишенью.

3.3 Резюме Лечение ХПН директора У Чжаодуна в основном направлено на питание селезенки и почек, питание ци и крови, разблокировку движения ци и удаление мутности из коллатералей. На основе платформы вспомогательной системы наследования ТКМ в этом исследовании было проведено исследование интеллектуального анализа данных о правилах приема лекарств директором Ву Чжаодуна и получены новые знания и новая информация, которые не были получены в результате традиционного сопоставления медицинских случаев и статистических исследований, а также предоставлена ​​полезная информация для директора Ву. Углубленные раскопки Чжаодуна и унаследованный опыт лечения ХПН. Ссылаться на.
С помощью сетевой фармакологии было установлено, что эффект Xinfang 1 при лечении ХПН является многокомпонентным и многоцелевым, и в основном он участвует в регуляции липидов и атеросклероза, NF-κB, Toll-подобных рецепторов, HIF{{ 5}} и другие пути ингибирования прогрессирования ХПН. Новая формула 1 изучена теоретически и экспериментально.
Механизм действия при лечении ХПН представляет собой ценный справочник по традиционной китайской медицине для лечения ХПН. Тем не менее, правила назначения, основные комбинации и новые назначения, полученные путем применения правил ассоциации и исследования кластеризации, все еще нуждаются в дальнейшей клинической проверке.

Вам также может понравиться