Отдельная клетка и иммунитет: лучшее понимание гетерогенности иммунных клеток с помощью секвенирования отдельных клеток

Dec 15, 2023

Хрупкий баланс иммунитета обеспечивается частыми перекрестными помехами и сложными взаимодействиями между различными типами клеток. Иммунные клетки очень гетерогенны по типам клеток и статусу активации. Методы тканевого и объемного секвенирования клеток фиксируют общие характеристики смешанных образцов, а также тонкие характеристики генов редких, но функционально важных типов клеток, покрытых многочисленными клеточными популяциями.

Cistanche deserticola-improve immunity

цистанхе трубчатой ​​– улучшает иммунную систему

Более того, внутри- и межклеточные коммуникации, несущие важные ключи к пролиферации, дифференцировке, созреванию, миграции и переходу иммунных клеток, трудно охарактеризовать с помощью традиционных методов. Текущий специальный выпуск направлен на то, чтобы сосредоточиться на быстром развитии одноклеточных исследований инфекционного иммунитета, иммунологии рака, врожденного иммунитета и нарушений иммунной системы, как показано на рисунке 1.

Desert ginseng-Improve immunity (12)

Польза цистанхе для мужчин – укрепление иммунной системы

Секвенирование одиночных клеток оказывает научное влияние на клинические и трансляционные открытия. За последнее десятилетие секвенирование одноклеточной РНК (scRNA-seq) вызвало настоящую революцию в иммунологических исследованиях. Являясь инструментом молекулярного профилирования отдельных клеток, технологии scRNA-seq позволяют лучше понять гетерогенность, связанную с отдельными иммунными клетками, и реакции на молекулярном уровне в физиологических и патологических условиях.1 Исследования, основанные на секвенировании отдельных клеток, успешно идентифицировали новые подмножества иммунных клеток и траектории развития.2 Инфекционные заболевания и рак представляют собой серьезную угрозу здоровью человека. Как воплотить наше понимание молекулярного механизма иммунной регуляции в клиническую терапию, остается большой проблемой.

Desert ginseng-Improve immunity (15)

растение цистанхе, повышающее иммунную систему

Нажмите здесь, чтобы просмотреть продукты Cistanche Enhance Immunity

【Запросить дополнительную информацию】 Электронная почта:cindy.xue@wecistanche.com / Whats App: 0086 18599088692 / Wechat: 18599088692

Благодаря технологии scRNA-seq были достигнуты крупные прорывы. Например, при исследовании отдельных клеток были обнаружены различные пути иммунного ответа между инфекциями, вызванными вирусом гриппа А и коронавирусом тяжелого острого респираторного синдрома-2 (SARS-CoV-2).3 SARS-CoV{{ 7}}нейтрализующие антитела были идентифицированы с помощью scRNA-seq обогащенных антигеном B-клеток пациентов с COVID-19.4 Были систематически построены межтканевый иммунный атлас и иммунный атлас развития человека.5,6 scRNA-seq Доказано, что эта технология является мощным инструментом для выявления механизмов ускользания иммунитета в опухолевых тканях.7

FIGURE 1 The topic of single cell and immunity is mainly focused on immune system disorders, infectious immunity, cancer immunity, inflammatory immunity, virus-associated immunity, and innate immunity. Schematic diagrams were created with BioRender.com.


РИСУНОК 1. Тема одиночных клеток и иммунитета в основном сосредоточена на нарушениях иммунной системы, инфекционном иммунитете, иммунитете к раку, воспалительном иммунитете, вирус-ассоциированном иммунитете и врожденном иммунитете. Схематические диаграммы были созданы с помощью BioRender.com.

Desert ginseng-Improve immunity (16)

цистанхе трубчатой ​​– улучшает иммунную систему

В инструментах анализа отдельных ячеек наблюдается быстрый прогресс. Для хранения и анализа наборов данных об отдельных клетках было разработано большое количество комплексных онлайн-баз данных.8–13 Срочно необходимо внедрить больше инновационных инструментов биоинформатики для интеграции данных, полученных из различных технологий и типов данных. Одной из важнейших задач является стандартизация аннотаций иммунных клеток и использование всего спектра типов данных. Это даст возможность сотрудничать в анализе данных между академическими кругами, промышленностью и клиническими учреждениями. Таким образом, скоординированные усилия по этому специальному выпуску будут способствовать нашему пониманию иммунологических исследований и методов лечения.

Desert ginseng-Improve immunity (23)

цистанхе трубчатой ​​– улучшает иммунную систему

ИСПОЛЬЗОВАННАЯ ЛИТЕРАТУРА

1. Гилади А., Амит И. Геномика одноклеточных клеток: ступенька для будущих открытий в иммунологии. Клетка. 2018;172(1):14-21. https://doi.org/10.1016/j.cell.2017.11.011

2. Папалекси Э., Сатия Р. Секвенирование одноклеточной РНК для изучения гетерогенности иммунных клеток. Нат Рев Иммунол. 2018;18(1):35-45. https://doi.org/10.1038/nri.2017.76

3. Чжу Л., Ян П., Чжао Ю. и др. Секвенирование отдельных клеток периферических мононуклеаров выявляет различные ландшафты иммунного ответа у пациентов с COVID-19 и гриппом. Иммунитет. 2020;53(3):685- 696. https://doi.org/10.1016/j.immuni.2020.07.009. е3.

4. Цао Ю, Су Б, Го Х и др. Мощные нейтрализующие антитела против SARS-CoV-2, выявленные с помощью высокопроизводительного одноклеточного секвенирования В-клеток выздоравливающих пациентов. Клетка. 2020;182(1):73-84. https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.05.025. е16.

5. Суо С., Данн Е., Го И. и др. Картирование развивающейся иммунной системы человека по органам. Наука. 2022;376(6597):eabo0510. https://doi.org/10.1126/science.abo0510

6. Домингес Конде С., Сюй С., Джарвис Л.Б. и др. Межтканевый анализ иммунных клеток выявляет тканеспецифичные особенности у человека. Наука. 2022;376(6594):eabl5197. https://doi.org/10.1126/science.abl5197

7. Чжан Ю, Ван Д., Пэн М. и др. Секвенирование одноклеточной РНК в исследованиях рака. J Exp Clin Cancer Res. 2021;40(1):81. https://дой. орг/10.1186/с13046-021-01874-1

8. Чен Д., Тан С., Дин П. и др. VThunter: база данных для одноклеточного скрининга клеток-мишеней вирусов в животном мире. Нуклеиновые кислоты Рез. 2022;50(D1):D934-D942. https://doi.org/10.1093/nar/gkab894

9. Чэнь Ю, Чжан Х, Пэн Х и др. СКОРОСТЬ: атлас одноклеточных панвидов в свете экологии и эволюции развития и болезней. Нуклеиновые кислоты Рез. https://doi.org/10.1093/nar/gkac930. Опубликовано в Интернете 28 октября 2022 г.: gkac930.

10. Хань Х, Ван Р, Чжоу Ю и др. Картирование атласа клеток мыши с помощью микролуночек-Seq. Клетка. 2018;172(5):1091-1107. https://doi.org/10. 1016/j.cell.2018.02.001. е17.

11. Чен Д., Сунь Дж., Чжу Дж. и др. Одноклеточный атлас 11 немодельных млекопитающих, рептилий и птиц. Нац Коммун. 2021;12(1):7083. https://doi.org/10.1038/s41467-021-27162-2

12. Хань Х, Чжоу З, Фей Л и др. Построение клеточного ландшафта человека на уровне отдельных клеток. Природа. 2020;581(7808):303-309. https://doi.org/10.1038/s41586-020-2157-4

13. Ма П, Лю X, Сюй Z и др. Совместное профилирование экспрессии генов и доступности хроматина во время развития амфиоксуса при разрешении отдельных клеток. Cell Rep. 2022;39(12). https://doi.org/10. 1016/j.celrep.2022.110979

Вам также может понравиться